Firefox kann wahlweise Links, die in einen neuem Fenster oeffnen auch in einem neuen Tab oder den aktuellen Fenster oeffnen. Das ist cool, weil man nicht dauernt durch einen Klick irgendwo neue Fenster bekommt.
Aber es gibt Situationen wo es auch total nervt. Wenn man z.B. hier beim schreiben auch "Weitere Smilies ansehen" klickt, dann oeffnet das im aktuellen Fenster oder in einem Tab. Das ist bescheiden und liegt daran, dass diese Option auch auf Javascript Open Aufrufe reagiert und somit auch auf "erwuenschte" Pop-up Fenster.
Man kann das aber aendern. Es gibt eine versteckte Option, die Firefox sagt "Wenn ein Fenster geoeffnet wird von JS und es eine Groessenangabe hat, keinen Toolbar, keinen Status Bar oder keine Adressleiste, dann ignoriere die Option und zeige es als Pop-up".
Geht super; nur weiss kein Schwein das sie da ist, wie sie heisst, welche Optionen sie kennt und der unbedarfte User hat sowieso noch nie was von user.js oder about:config gehoert.
Man koennte diese Option aber auch Default machen. Nur wollen das die Herren von Firefox nicht, was total unlogisch und unerklaerlich ist. 
Wer bitte will das Pop-ups den aktuellen Fensterinhalt killen oder Tabs erzeugen (wo sie zwangswese auf Fenstergroesse resized werden!). Und manchmal machen solche Pop-Ups nur Sinn, wenn sie parallel zum Hauptfenster sichbar sind. Zig Seiten im Internet sind unbenutzbar so wie die Default Option im Moment ist.
Also bin ich der Meinung, dass wen man die Zwangs-Option einschaltet, fuer die bestimmten Javascript Fenster immer eine Ausnahme gemacht werden sollte. Natuerlich nur dann, wenn es keine Auto-Pop-Ups sind, weil die werden ja sowieso vom Pop-Up-Blocker gekillt (egal ob oder wie man diese Option setzt); was ja auch gut so ist 
Wer also auch der Meinung ist, die Default Option muss geaendert werden, bitte zum Bugreport gehen, voten und vielleicht auch ein Kommentar schreiben.
Bug: 266299
https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=266299
Wenn sich genug Leute beschweren, dann werden sie es naemlich aendern, wurde mir versichert. Nur sind sie tatsaechlich der Meinung, die User wollen dieses irrationale Verhalten.