Mhmm, ich habe zwei Platten, einmal C mit der Zusazpartition E und zweite Platte F. Die Systemverwaltung von Win zeigt mir an, dass C fehlerfrei ist und aus zwei Partitionen besteht, Partition magic hingegen zeigt "Fehler" an, zudem wird Partition E nicht angezeigt. Wem soll ich trauen und wie kann ich denn jetzt näheres erfahren?

Platte fehlerfrei oder nicht?
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Schau mal auf der Website deines Festplattenherstellers nach, eventuell gibt es dort einen Online Test der die Platte auf Fehler überprüft. Ansonsten musst du dir ein Programm besorgen das S.M.A.R.T. auslesen kann, das ist sowas wie ein Fehlerspeicher.
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Etwas mächtigeres als SpinRite gibt es nicht.