Hab das gleiche Problem, allerdings kein NoScript installiert.
Es ist so, als würde sich hinter dem eigentlichen Video noch ein Video starten, bei einem Klick auf Pause wird aber nur das Video im Vordergrund pausiert, sodass das Video im Hintergrund einfach weiterläuft und sich nicht beenden lässt. Tritt allerdings nur bei Videos auf, die den neuen Youtube-Player benutzen. Sehr nervig das Ganze...ich mach mich jetzt mal ans Add-on deaktivieren.
Firefox 12.0
Adblock Plus 2.0.3
AutoPager 0.7.1.4
ProxTube 1.4.2
Quickjava 1.7.5
EDIT: Es lag bei mir an AutoPager! Habe in den Einstellungen youtube.com in "ignorierte Websites" reingeschrieben und jetzt tut wieder alles 