"a" hätte nicht passieren sollen, und ist auf jeden Fall nicht normal.
"b" verstehe ich nicht, wo genau sind welche Links nicht mehr markiert? Im Browser? Oder wo sonst?
"c" kann ich nichts zu sagen, aber beim Web Developer wurde viel gearbeitet.
Allgemein ist es so das Einstellungen bei einem Update erhalten bleiben (sollten).
Wenn das bei dir nicht der Fall war ist etwas in die Hose gegangen.
Und ich vermute in deinem Fall nicht das erste Mal? Zumindest lässt deine Aussage "ich habs ungern getan," darauf schließen.
Evtl gibt es größere Probleme in deinem Profil.
Wenn du die Einstellungen (das Profil) gesichert hättest, hättest du es auch mit der neuesten Version verwenden können.
Aber das löst dein Problem auch nur ein bisschen.