du machst am besten mit einer fertigen installation die optische anpassung. dann beendest du firefox und findest im aktuellen userprofile die datei "localstore.rdf". dort sind die ganzen einstellung gespeichert.
zum v2 installer: hab nochmal eine ueberarbeitete version in die zip gepackt, die jetzt auch uninstall und backup der registry sowie userprofile bietet. das batchscript ist ca 350 zeilen lang weswegen ich das posten davon hier lieber lasse.
edit: ich hab nochmal ueberlegt was eine ursache bei der 1.0 install gewesen kann. die datei chrome.rdf unter locale_settings\sprache\chrome , welche bei einigen system wo die install ohne nicht ging weiterholf. kann sein dass dies aber genau bei dir das gegenteil bewirkt.
bc