Nein, den Haken bei "Passwörter speichern" musst du drin lassen. SecureLogin nutzt den integrierten Passwort-Manager von Firefox. Der Unterschied ist das eigentliche "Einloggen".
Auch die Cookies kannst du aktiviert lassen. Ohne Cookies wirst du bei manchen Seiten erst gar nicht eingeloggt, wenn sie deine Session nicht auch über die URL speichern.
Das du trotzdem schon eingeloggt bist liegt an deinen schon gespeicherten Cookies. Das ist aber in Ordnung so.
SecureLogin ist dazu da, dich sicher und komfortabel bei Seiten einzuloggen, für die du noch keine Cookie gespeichert hast, deren Cookies du schon gelöscht hast oder deren Cookie-Session schon abgelaufen ist.