Ich könnte wetten das Tool was du verwendest benutzt neben dem <object>-Tag auch den <embed>-Tag. Da der IE seine ganz eigenen Angaben für das Einbinden von Plugins haben will, wird das <object> für alle anderen Browser unbrauchbar. Dafür gibt es dann den Fallback in Form von <embed>. Die <param> sind aber nur für <object>. Firefox führt also <embed> aus und nicht <object> und kennt damit auch nicht die angegeben <param>.
Das Firefox ein Flash ganz gerne nach ganz oben legt, ist mir bekannt. Da ich aber nicht mit Flash oder Plugins arbeite, kann ich Dir jetzt keine Patentlösung anbieten.