Hi stepp,
ich selbst verwende MinimizeToTray 0.0.1.2005091606+ (Link) sowohl im FX 1.0.7 als auch im TB 1.0.7 und habe bisher keine Probleme damit bemerkt. Die Erweiterung speichert ihre Einstellungen, die verändert wurden (von der Standardeinstellung abweichen) in der Datei "prefs.js" (Link) des jeweiligen Profils (Link) ab. Ein möglicher Grund könnte daher sein, dass die Datei "prefs.js" schriebgeschützt ist (aus welchem Grund auch immer). Wie gesagt, befindet sich die Datei im Ordner des verwendeten Profils, diese wiederum liegen allesamt (falls mehrere Profile eingerichtet wurden) im Profilordner (Link).
Have fun,
NightHawk