Hallo!
Hört sich für mich danach an, als ob nach dem Update ein anderes Verzeichnis für die Profiles genutzt wird. Kann beim Wechsel auf snap-Pakete wohl passieren. Vermutlich hast Du in Deinem Home-Verzeichnis die Verzeichnisse ".mozilla" und ".thunderbird", aber auch ein "snap" Verzeichnis mit Verzeichnissen der Firefox- und Thunderbird-Snaps. Wo Deine "verlorenen" Daten nun liegen, musst Du selber schauen.
Hier kann man dazu was lesen: https://wiki.ubuntuusers.de/snap/#Konfigur…aps-uebernehmen
Das ist aber nur ein Schuss ins Blaue, da ich kein Ubuntu nutze.
Gruß
Andreas